Uma história de vingança.

Hanachirasu se passa em uma linha do tempo paralela onde as armas nucleares nunca foram desenvolvidas. Assim, o Japão continuou a lutar durante a Segunda Guerra Mundial, encerrando as hostilidades somente quando Hokkaido e Kyushu foram ocupadas pela Rússia e pelos Estados Unidos, respectivamente.

O jogo em si se passa no início do século 21, em Tóquio, que se transformou em um refúgio para a cultura japonesa graças aos ideais nacionalistas do carismático Ishima Kaigen. Políticas rigorosas estão em vigor para impor a proibição de armas de fogo dentro dos limites da cidade. Assim, embora o terrorismo e as lutas pelo poder sejam galopantes, são as lutas com espadas, e não os tiros, que ceifam as vidas daqueles que não têm poder para reivindicar seus direitos aqui.

Nosso protagonista é Takeda Akane, um espadachim movido pelo desejo de enfrentar seu único e verdadeiro rival, Igarasu Yoshia. O que se interporá em seu caminho rumo ao seu objetivo?